| Fr., 30.11.2012 | SpVgg Unterhaching - SV Darmstadt 98 | 2:2 |
| Sa., 01.12.2012 | Alemannia Aachen - Arminia Bielefeld | 2:1 |
| Sa., 01.12.2012 | SC Preußen Münster - SV Wacker Burghausen | 2:0 |
| Sa., 01.12.2012 | Borussia Dortmund II - VfL Osnabrück | 1:1 |
| Sa., 01.12.2012 | 1. FC Saarbrücken - VfB Stuttgart II | 0:0 |
| Sa., 01.12.2012 | Kickers Offenbach - Hallescher FC | 0:1 |
| Sa., 01.12.2012 | Karlsruher SC - 1. FC Heidenheim 1846 | 5:2 |
| Sa., 01.12.2012 | FC Rot-Weiß Erfurt - SV Wehen Wiesbaden | 2:2 |
| Sa., 01.12.2012 | Stuttgarter Kickers - FC Hansa Rostock | 2:0 |
| Sa., 01.12.2012 | SV Babelsberg 03 - Chemnitzer FC | 1:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | VfL Osnabrück | 20 | 12-5-3 | 28:13 | 15 | 41 | |
| 2. | |  | SC Preußen Münster | 20 | 11-6-3 | 33:15 | 18 | 39 | |
| 3. |  |  | Karlsruher SC | 20 | 10-7-3 | 34:13 | 21 | 37 | |
| 4. |  |  | Arminia Bielefeld | 20 | 10-6-4 | 29:19 | 10 | 36 | |
| 5. | |  | SpVgg Unterhaching | 20 | 10-6-4 | 35:26 | 9 | 36 | |
| 6. | |  | 1. FC Heidenheim 1846 | 20 | 9-4-7 | 34:31 | 3 | 31 | |
| 7. | |  | VfB Stuttgart II | 20 | 8-5-7 | 26:22 | 4 | 29 | |
| 8. | |  | SV Wacker Burghausen | 20 | 9-2-9 | 26:28 | -2 | 29 | |
| 9. | |  | FC Hansa Rostock | 20 | 8-5-7 | 22:26 | -4 | 29 | |
| 10. | |  | Kickers Offenbach | 20 | 7-5-8 | 29:24 | 5 | 26 | |
| 11. | |  | Chemnitzer FC | 20 | 7-5-8 | 28:26 | 2 | 26 | |
| 12. | |  | 1. FC Saarbrücken | 20 | 7-4-9 | 28:32 | -4 | 25 | |
| 13. | |  | SV Babelsberg 03 | 20 | 6-5-9 | 17:26 | -9 | 23 | |
| 14. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 20 | 3-13-4 | 26:29 | -3 | 22 | |
| 15. | |  | Hallescher FC | 20 | 5-6-9 | 17:28 | -11 | 21 | |
| 16. | |  | Stuttgarter Kickers | 20 | 5-5-10 | 21:23 | -2 | 20 | |
| 17. | |  | Alemannia Aachen | 20 | 4-7-9 | 20:30 | -10 | 19 | |
| 18. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 20 | 4-7-9 | 23:36 | -13 | 19 | |
| 19. | |  | Borussia Dortmund II | 20 | 4-6-10 | 17:34 | -17 | 18 | |
| 20. | |  | SV Darmstadt 98 | 20 | 3-7-10 | 18:30 | -12 | 16 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Je zwei Punkte Abzug für Alemannia Aachen und Offenbacher Kickers aufgrund Lizenzverstößen ab 29. Spieltag bereits eingerechnet. Ein weiterer Abzug von 3 Punkten für Alemannia Aachen nach dem 37. Spieltag ist ebenfalls eingerechnet. Die Offenbacher Kickers erhielten keine Lizenz für die folgende Spielzeit 2013/2014 und müssen deshalb absteigen. Dafür verbleibt der sportliche Absteiger SV Darmstadt 98 in der Liga. | |||||||||