| Fr., 02.12.2016 | SC Preußen Münster - Chemnitzer FC | 1:0 |
| Fr., 02.12.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - SV Wehen Wiesbaden | 2:1 |
| Fr., 02.12.2016 | SSV Jahn Regensburg - FC Rot-Weiß Erfurt | 0:1 |
| Sa., 03.12.2016 | FSV Zwickau - SC Paderborn | 3:0 |
| Sa., 03.12.2016 | SC Fortuna Köln - VfL Osnabrück | 1:1 |
| Sa., 03.12.2016 | VfR Aalen - FSV Mainz 05 II | 0:0 |
| Sa., 03.12.2016 | Hallescher FC - SV Werder Bremen II | 2:0 |
| Sa., 03.12.2016 | FC Hansa Rostock - Holstein Kiel | 1:4 |
| So., 04.12.2016 | SF Lotte - MSV Duisburg | 0:2 |
| So., 04.12.2016 | FSV Frankfurt - 1. FC Magdeburg | 0:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 17 | 8-7-2 | 18:10 | 8 | 31 | |
| 2. | |  | VfL Osnabrück | 17 | 8-5-4 | 24:19 | 5 | 29 | |
| 3. |  |  | Hallescher FC | 17 | 7-7-3 | 19:13 | 6 | 28 | |
| 4. | |  | Holstein Kiel | 17 | 7-6-4 | 25:13 | 12 | 27 | |
| 5. | |  | 1. FC Magdeburg | 17 | 8-3-6 | 24:19 | 5 | 27 | |
| 6. |  |  | Chemnitzer FC | 17 | 7-5-5 | 27:19 | 8 | 26 | |
| 7. | |  | VfR Aalen | 17 | 5-10-2 | 19:14 | 5 | 25 | |
| 8. | |  | SF Lotte | 17 | 7-4-6 | 24:20 | 4 | 25 | |
| 9. | |  | SC Fortuna Köln | 17 | 7-4-6 | 18:25 | -7 | 25 | |
| 10. | |  | FC Hansa Rostock | 17 | 5-8-4 | 21:17 | 4 | 23 | |
| 11. | |  | FSV Frankfurt | 17 | 5-7-5 | 24:16 | 8 | 22 | |
| 12. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 17 | 6-4-7 | 25:21 | 4 | 22 | |
| 13. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 17 | 6-4-7 | 14:21 | -7 | 22 | |
| 14. | |  | SC Preußen Münster | 17 | 6-3-8 | 20:19 | 1 | 21 | |
| 15. | |  | SSV Jahn Regensburg | 17 | 6-3-8 | 25:28 | -3 | 21 | |
| 16. | |  | SV Werder Bremen II | 17 | 6-2-9 | 17:28 | -11 | 20 | |
| 17. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 17 | 5-4-8 | 19:21 | -2 | 19 | |
| 18. | |  | SC Paderborn | 17 | 5-3-9 | 18:35 | -17 | 18 | |
| 19. | |  | FSV Zwickau | 17 | 4-4-9 | 19:27 | -8 | 16 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 17 | 3-5-9 | 14:29 | -15 | 14 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||