| Sa., 04.02.2017 | Chemnitzer FC - Hallescher FC | 1:1 |
| Sa., 04.02.2017 | FSV Mainz 05 II - SC Paderborn | 0:1 |
| Sa., 04.02.2017 | SV Wehen Wiesbaden - SF Lotte | 0:3 |
| Sa., 04.02.2017 | Holstein Kiel - VfR Aalen | 2:2 |
| Sa., 04.02.2017 | FC Rot-Weiß Erfurt - FSV Frankfurt | 1:0 |
| Sa., 04.02.2017 | SSV Jahn Regensburg - SG Sonnenhof Großaspach | 1:1 |
| Sa., 04.02.2017 | MSV Duisburg - VfL Osnabrück | 2:2 |
| So., 05.02.2017 | 1. FC Magdeburg - FSV Zwickau | 1:1 |
| So., 05.02.2017 | SV Werder Bremen II - SC Fortuna Köln | 1:1 |
| So., 05.02.2017 | SC Preußen Münster - FC Hansa Rostock | 3:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 21 | 10-9-2 | 24:13 | 11 | 39 | |
| 2. | |  | VfL Osnabrück | 21 | 10-6-5 | 31:24 | 7 | 36 | |
| 3. | |  | 1. FC Magdeburg | 21 | 10-4-7 | 32:23 | 9 | 34 | |
| 4. | |  | Hallescher FC | 21 | 8-10-3 | 22:15 | 7 | 34 | |
| 5. | |  | SC Fortuna Köln | 21 | 9-5-7 | 22:29 | -7 | 32 | |
| 6. | |  | Chemnitzer FC | 21 | 8-7-6 | 33:26 | 7 | 31 | |
| 7. |  |  | SF Lotte | 21 | 9-4-8 | 31:25 | 6 | 31 | |
| 8. |  |  | Holstein Kiel | 21 | 7-9-5 | 28:17 | 11 | 30 | |
| 9. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 21 | 8-6-7 | 32:26 | 6 | 30 | |
| 10. | |  | VfR Aalen | 21 | 6-12-3 | 25:20 | 5 | 30 | |
| 11. | |  | SSV Jahn Regensburg | 21 | 8-5-8 | 32:30 | 2 | 29 | |
| 12. | |  | FSV Frankfurt | 21 | 6-9-6 | 27:18 | 9 | 27 | |
| 13. | |  | FC Hansa Rostock | 21 | 6-9-6 | 25:24 | 1 | 27 | |
| 14. | |  | SC Paderborn | 21 | 8-3-10 | 23:37 | -14 | 27 | |
| 15. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 21 | 7-4-10 | 17:26 | -9 | 25 | |
| 16. | |  | SV Werder Bremen II | 21 | 7-4-10 | 20:33 | -13 | 25 | |
| 17. | |  | SC Preußen Münster | 21 | 7-3-11 | 24:27 | -3 | 24 | |
| 18. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 21 | 5-6-10 | 22:29 | -7 | 21 | |
| 19. | |  | FSV Zwickau | 21 | 5-6-10 | 22:30 | -8 | 21 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 21 | 3-5-13 | 14:34 | -20 | 14 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||