| Fr., 24.02.2017 | MSV Duisburg - 1. FC Magdeburg | 0:0 |
| Fr., 24.02.2017 | SC Paderborn - SV Wehen Wiesbaden | 0:1 |
| Fr., 24.02.2017 | VfL Osnabrück - SV Werder Bremen II | 0:1 |
| Sa., 25.02.2017 | FSV Mainz 05 II - SC Preußen Münster | 3:1 |
| Sa., 25.02.2017 | SC Fortuna Köln - FC Rot-Weiß Erfurt | 0:1 |
| Sa., 25.02.2017 | Hallescher FC - SG Sonnenhof Großaspach | 0:1 |
| Sa., 25.02.2017 | FSV Frankfurt - FC Hansa Rostock | 0:0 |
| Sa., 25.02.2017 | VfR Aalen - SSV Jahn Regensburg | 1:2 |
| So., 26.02.2017 | FSV Zwickau - Holstein Kiel | 1:0 |
| Mi., 08.03.2017 | SF Lotte - Chemnitzer FC | 3:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 24 | 12-10-2 | 29:15 | 14 | 46 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 24 | 11-6-7 | 36:24 | 12 | 39 | |
| 3. |  |  | SSV Jahn Regensburg | 24 | 10-6-8 | 37:33 | 4 | 36 | |
| 4. |  |  | VfL Osnabrück | 24 | 10-6-8 | 32:30 | 2 | 36 | |
| 5. | |  | Hallescher FC | 24 | 8-11-5 | 23:18 | 5 | 35 | |
| 6. | |  | Chemnitzer FC | 23 | 9-7-7 | 36:27 | 9 | 34 | |
| 7. | |  | SF Lotte | 22 | 10-4-8 | 34:25 | 9 | 34 | |
| 8. | |  | VfR Aalen | 24 | 7-13-4 | 28:23 | 5 | 34 | |
| 9. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 24 | 9-7-8 | 34:30 | 4 | 34 | |
| 10. | |  | Holstein Kiel | 23 | 8-9-6 | 33:19 | 14 | 33 | |
| 11. | |  | SC Fortuna Köln | 24 | 9-6-9 | 23:35 | -12 | 33 | |
| 12. | |  | FC Hansa Rostock | 24 | 7-11-6 | 27:25 | 2 | 32 | |
| 13. | |  | SV Werder Bremen II | 24 | 9-4-11 | 23:35 | -12 | 31 | |
| 14. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 24 | 8-5-11 | 19:30 | -11 | 29 | |
| 15. | |  | FSV Frankfurt | 24 | 6-10-8 | 28:23 | 5 | 28 | |
| 16. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 24 | 7-7-10 | 26:29 | -3 | 28 | |
| 17. | |  | SC Paderborn | 24 | 8-4-12 | 24:40 | -16 | 28 | |
| 18. | |  | SC Preußen Münster | 24 | 8-3-13 | 30:33 | -3 | 27 | |
| 19. | |  | FSV Zwickau | 24 | 7-6-11 | 25:34 | -9 | 27 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 24 | 5-5-14 | 19:38 | -19 | 20 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||