| Sa., 22.04.2017 | Holstein Kiel - Chemnitzer FC | 2:0 |
| Sa., 22.04.2017 | SC Paderborn - SF Lotte | 3:1 |
| Sa., 22.04.2017 | VfL Osnabrück - VfR Aalen | 1:0 |
| Sa., 22.04.2017 | MSV Duisburg - FSV Frankfurt | 3:2 |
| Sa., 22.04.2017 | FSV Mainz 05 II - Hallescher FC | 3:2 |
| Sa., 22.04.2017 | 1. FC Magdeburg - SG Sonnenhof Großaspach | 2:1 |
| Sa., 22.04.2017 | SV Werder Bremen II - FC Hansa Rostock | 0:2 |
| Sa., 22.04.2017 | SV Wehen Wiesbaden - SSV Jahn Regensburg | 1:1 |
| So., 23.04.2017 | FC Rot-Weiß Erfurt - SC Preußen Münster | 0:0 |
| So., 23.04.2017 | FSV Zwickau - SC Fortuna Köln | 2:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 34 | 16-13-5 | 42:28 | 14 | 61 | |
| 2. |  |  | Holstein Kiel | 34 | 14-13-7 | 50:24 | 26 | 55 | |
| 3. | |  | 1. FC Magdeburg | 34 | 15-10-9 | 47:32 | 15 | 55 | |
| 4. |  |  | SSV Jahn Regensburg | 34 | 15-9-10 | 54:44 | 10 | 54 | |
| 5. | |  | VfR Aalen | 34 | 13-14-7 | 48:30 | 18 | 53 | |
| 6. | |  | VfL Osnabrück | 34 | 15-7-12 | 45:40 | 5 | 52 | |
| 7. | |  | FSV Zwickau | 34 | 15-7-12 | 43:43 | 0 | 52 | |
| 8. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 34 | 14-7-13 | 47:43 | 4 | 49 | |
| 9. | |  | Chemnitzer FC | 34 | 13-9-12 | 49:44 | 5 | 48 | |
| 10. | |  | FC Hansa Rostock | 34 | 10-16-8 | 41:37 | 4 | 46 | |
| 11. | |  | Hallescher FC | 34 | 10-16-8 | 32:31 | 1 | 46 | |
| 12. | |  | SF Lotte | 34 | 13-6-15 | 42:41 | 1 | 45 | |
| 13. | |  | SC Preußen Münster | 34 | 13-6-15 | 41:40 | 1 | 45 | |
| 14. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 34 | 11-10-13 | 35:40 | -5 | 43 | |
| 15. | |  | SC Fortuna Köln | 34 | 11-10-13 | 35:50 | -15 | 43 | |
| 16. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 34 | 10-10-14 | 26:40 | -14 | 40 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 34 | 10-7-17 | 26:47 | -21 | 37 | |
| 18. | |  | SC Paderborn | 34 | 10-6-18 | 35:56 | -21 | 36 | |
| 19. | |  | FSV Frankfurt | 34 | 7-12-15 | 35:39 | -4 | 33 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 34 | 8-6-20 | 30:54 | -24 | 30 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||