| Fr., 12.09.2008 | FC Sachsen Leipzig - VfL Wolfsburg II | 1:0 |
| Fr., 12.09.2008 | VFC Plauen - FC Hansa Rostock II | 2:0 |
| Sa., 13.09.2008 | Altonaer FC 93 - Holstein Kiel | 1:6 |
| Sa., 13.09.2008 | 1. FC Magdeburg - Hallescher FC | 1:2 |
| Sa., 13.09.2008 | SV Wilhelmshaven - Hamburger SV II | 0:4 |
| Sa., 13.09.2008 | VfB Lübeck - Hertha BSC Berlin II | 4:0 |
| So., 14.09.2008 | FC Energie Cottbus II - SV Babelsberg 03 | 0:1 |
| So., 14.09.2008 | Türkiyemspor Berlin - Hannover 96 II | 1:2 |
| Mi., 01.10.2008 | FC Oberneuland 1948 - Chemnitzer FC | 1:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | SV Babelsberg 03 | 4 | 3-1-0 | 5:1 | 4 | 10 |
| 2. | |  | Holstein Kiel | 4 | 3-0-1 | 9:4 | 5 | 9 |
| 3. | |  | Hamburger SV II | 4 | 2-2-0 | 8:3 | 5 | 8 |
| 4. | |  | Hallescher FC | 4 | 2-2-0 | 4:2 | 2 | 8 |
| 5. |  |  | SV Wilhelmshaven | 5 | 2-2-1 | 7:7 | 0 | 8 |
| 6. | |  | VfL Wolfsburg II | 4 | 2-1-1 | 6:2 | 4 | 7 |
| 7. | |  | VFC Plauen | 4 | 1-3-0 | 6:4 | 2 | 6 |
| 8. | |  | Hannover 96 II | 4 | 2-0-2 | 4:5 | -1 | 6 |
| 9. | |  | FC Hansa Rostock II | 4 | 2-0-2 | 4:6 | -2 | 6 |
| 10. | |  | Altonaer FC 93 | 4 | 2-0-2 | 8:11 | -3 | 6 |
| 11. | |  | FC Sachsen Leipzig | 4 | 1-2-1 | 3:3 | 0 | 5 |
| 12. | |  | FC Oberneuland 1948 | 3 | 1-1-1 | 3:3 | 0 | 4 |
| 13. | |  | Türkiyemspor Berlin | 4 | 1-1-2 | 5:7 | -2 | 4 |
| 14. | |  | Hertha BSC Berlin II | 5 | 1-1-3 | 5:12 | -7 | 4 |
| 15. | |  | VfB Lübeck | 4 | 1-0-3 | 5:4 | 1 | 3 |
| 16. | |  | 1. FC Magdeburg | 4 | 1-0-3 | 3:5 | -2 | 3 |
| 17. | |  | Chemnitzer FC | 3 | 0-1-2 | 5:7 | -2 | 1 |
| 18. | |  | FC Energie Cottbus II | 4 | 0-1-3 | 2:6 | -4 | 1 |