| Do., 18.09.2003 | 1. FC Köln II - SV Werder Bremen II | 2:0 |
| Fr., 19.09.2003 | Rot-Weiß Essen - 1. FC Dynamo Dresden | 2:0 |
| Sa., 20.09.2003 | Chemnitzer FC - FC St. Pauli | 1:2 |
| Sa., 20.09.2003 | SC Paderborn - SG Wattenscheid 09 | 3:2 |
| Sa., 20.09.2003 | Borussia Dortmund II - KFC Uerdingen | 1:0 |
| Sa., 20.09.2003 | Hamburger SV II - SC Preußen Münster | 1:1 |
| Sa., 20.09.2003 | Holstein Kiel - Wuppertaler SV | 1:1 |
| So., 21.09.2003 | FC Sachsen Leipzig - VfR Neumünster | 3:1 |
| So., 21.09.2003 | FC Schalke 04 II - Eintracht Braunschweig | 3:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Eintracht Braunschweig | 8 | 6-1-1 | 16:8 | 8 | 19 |
| 2. | |  | Wuppertaler SV | 8 | 5-2-1 | 14:6 | 8 | 17 |
| 3. | |  | Borussia Dortmund II | 8 | 5-2-1 | 15:9 | 6 | 17 |
| 4. |  |  | SC Paderborn | 8 | 5-2-1 | 12:8 | 4 | 17 |
| 5. | |  | Rot-Weiß Essen | 8 | 4-2-2 | 14:9 | 5 | 14 |
| 6. |  |  | Chemnitzer FC | 8 | 4-2-2 | 10:7 | 3 | 14 |
| 7. | |  | FC Schalke 04 II | 8 | 4-1-3 | 16:14 | 2 | 13 |
| 8. | |  | 1. FC Dynamo Dresden | 8 | 3-3-2 | 15:10 | 5 | 12 |
| 9. | |  | FC St. Pauli | 8 | 3-3-2 | 15:10 | 5 | 12 |
| 10. | |  | SV Werder Bremen II | 8 | 3-3-2 | 10:9 | 1 | 12 |
| 11. | |  | KFC Uerdingen | 8 | 3-2-3 | 13:11 | 2 | 11 |
| 12. | |  | 1. FC Köln II | 8 | 2-4-2 | 13:11 | 2 | 10 |
| 13. | |  | SG Wattenscheid 09 | 8 | 2-1-5 | 15:20 | -5 | 7 |
| 14. | |  | SC Preußen Münster | 8 | 1-3-4 | 7:14 | -7 | 6 |
| 15. | |  | FC Sachsen Leipzig | 8 | 1-2-5 | 11:17 | -6 | 5 |
| 16. | |  | Holstein Kiel | 8 | 1-2-5 | 11:19 | -8 | 5 |
| 17. | |  | Hamburger SV II | 8 | 1-2-5 | 7:17 | -10 | 5 |
| 18. | |  | VfR Neumünster | 8 | 0-1-7 | 5:20 | -15 | 1 |