| Fr., 28.10.2016 | VfR Aalen - FSV Zwickau | 0:1 |
| Sa., 29.10.2016 | Chemnitzer FC - SV Werder Bremen II | 1:1 |
| Sa., 29.10.2016 | SC Preußen Münster - Holstein Kiel | 1:1 |
| Sa., 29.10.2016 | FC Rot-Weiß Erfurt - SV Wehen Wiesbaden | 1:0 |
| Sa., 29.10.2016 | SF Lotte - SC Fortuna Köln | 0:1 |
| Sa., 29.10.2016 | FSV Frankfurt - SC Paderborn | 3:0 |
| Sa., 29.10.2016 | Hallescher FC - VfL Osnabrück | 1:0 |
| Sa., 29.10.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - MSV Duisburg | 0:0 |
| Sa., 29.10.2016 | FC Hansa Rostock - FSV Mainz 05 II | 1:1 |
| Sa., 29.10.2016 | SSV Jahn Regensburg - 1. FC Magdeburg | 1:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 13 | 7-4-2 | 14:8 | 6 | 25 | |
| 2. | |  | VfL Osnabrück | 13 | 7-2-4 | 18:16 | 2 | 23 | |
| 3. | |  | VfR Aalen | 13 | 5-6-2 | 16:11 | 5 | 21 | |
| 4. | |  | SF Lotte | 13 | 6-3-4 | 17:14 | 3 | 21 | |
| 5. |  |  | Hallescher FC | 13 | 5-6-2 | 15:12 | 3 | 21 | |
| 6. | |  | FSV Frankfurt | 13 | 5-5-3 | 23:13 | 10 | 20 | |
| 7. |  |  | FC Hansa Rostock | 13 | 5-5-3 | 17:10 | 7 | 20 | |
| 8. | |  | SC Fortuna Köln | 13 | 6-2-5 | 14:21 | -7 | 20 | |
| 9. | |  | Holstein Kiel | 13 | 5-4-4 | 17:9 | 8 | 19 | |
| 10. | |  | Chemnitzer FC | 13 | 5-4-4 | 20:15 | 5 | 19 | |
| 11. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 13 | 5-3-5 | 16:12 | 4 | 18 | |
| 12. | |  | SSV Jahn Regensburg | 13 | 5-3-5 | 20:21 | -1 | 18 | |
| 13. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 13 | 5-3-5 | 12:15 | -3 | 18 | |
| 14. | |  | 1. FC Magdeburg | 13 | 5-2-6 | 18:17 | 1 | 17 | |
| 15. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 13 | 4-4-5 | 20:16 | 4 | 16 | |
| 16. | |  | SC Paderborn | 13 | 5-1-7 | 17:25 | -8 | 16 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 13 | 4-1-8 | 12:24 | -12 | 13 | |
| 18. | |  | FSV Zwickau | 13 | 3-3-7 | 14:23 | -9 | 12 | |
| 19. | |  | FSV Mainz 05 II | 13 | 2-4-7 | 13:25 | -12 | 10 | |
| 20. | |  | SC Preußen Münster | 13 | 2-3-8 | 13:19 | -6 | 9 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||