| Fr., 18.11.2016 | SC Preußen Münster - FC Rot-Weiß Erfurt | 4:0 |
| Fr., 18.11.2016 | SC Fortuna Köln - FSV Zwickau | 2:1 |
| Fr., 18.11.2016 | VfR Aalen - VfL Osnabrück | 1:1 |
| Sa., 19.11.2016 | Chemnitzer FC - Holstein Kiel | 2:2 |
| Sa., 19.11.2016 | SF Lotte - SC Paderborn | 6:0 |
| Sa., 19.11.2016 | FSV Frankfurt - MSV Duisburg | 0:0 |
| Sa., 19.11.2016 | Hallescher FC - FSV Mainz 05 II | 2:0 |
| Sa., 19.11.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - 1. FC Magdeburg | 1:3 |
| Sa., 19.11.2016 | FC Hansa Rostock - SV Werder Bremen II | 1:1 |
| Sa., 19.11.2016 | SSV Jahn Regensburg - SV Wehen Wiesbaden | 3:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 15 | 7-6-2 | 14:8 | 6 | 27 | |
| 2. |  |  | SF Lotte | 15 | 7-4-4 | 24:15 | 9 | 25 | |
| 3. | |  | Hallescher FC | 15 | 6-7-2 | 17:12 | 5 | 25 | |
| 4. |  |  | VfL Osnabrück | 15 | 7-4-4 | 20:18 | 2 | 25 | |
| 5. | |  | Chemnitzer FC | 15 | 6-5-4 | 25:17 | 8 | 23 | |
| 6. | |  | VfR Aalen | 15 | 5-8-2 | 17:12 | 5 | 23 | |
| 7. | |  | SC Fortuna Köln | 15 | 7-2-6 | 16:23 | -7 | 23 | |
| 8. | |  | FSV Frankfurt | 15 | 5-7-3 | 24:14 | 10 | 22 | |
| 9. | |  | FC Hansa Rostock | 15 | 5-7-3 | 19:12 | 7 | 22 | |
| 10. | |  | Holstein Kiel | 15 | 5-6-4 | 19:11 | 8 | 21 | |
| 11. | |  | 1. FC Magdeburg | 15 | 6-3-6 | 22:19 | 3 | 21 | |
| 12. | |  | SSV Jahn Regensburg | 15 | 6-3-6 | 24:25 | -1 | 21 | |
| 13. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 15 | 5-4-6 | 23:19 | 4 | 19 | |
| 14. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 15 | 5-4-6 | 12:19 | -7 | 19 | |
| 15. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 15 | 5-3-7 | 17:18 | -1 | 18 | |
| 16. | |  | SV Werder Bremen II | 15 | 5-2-8 | 16:26 | -10 | 17 | |
| 17. | |  | SC Paderborn | 15 | 5-2-8 | 17:31 | -14 | 17 | |
| 18. | |  | SC Preußen Münster | 15 | 4-3-8 | 18:19 | -1 | 15 | |
| 19. | |  | FSV Zwickau | 15 | 3-4-8 | 16:26 | -10 | 13 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 15 | 2-4-9 | 13:29 | -16 | 10 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||