| Fr., 05.08.2016 | SC Fortuna Köln - SV Werder Bremen II | 2:0 |
| Fr., 05.08.2016 | FC Hansa Rostock - SC Preußen Münster | 1:0 |
| Sa., 06.08.2016 | Hallescher FC - Chemnitzer FC | 1:1 |
| Sa., 06.08.2016 | SC Paderborn - FSV Mainz 05 II | 3:1 |
| Sa., 06.08.2016 | SF Lotte - SV Wehen Wiesbaden | 0:0 |
| Sa., 06.08.2016 | VfR Aalen - Holstein Kiel | 1:0 |
| Sa., 06.08.2016 | FSV Frankfurt - FC Rot-Weiß Erfurt | 0:1 |
| So., 07.08.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - SSV Jahn Regensburg | 3:4 |
| So., 07.08.2016 | VfL Osnabrück - MSV Duisburg | 1:1 |
| Do., 01.09.2016 | FSV Zwickau - 1. FC Magdeburg | 0:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | SC Fortuna Köln | 2 | 2-0-0 | 5:0 | 5 | 6 | |
| 2. |  |  | SSV Jahn Regensburg | 2 | 2-0-0 | 6:3 | 3 | 6 | |
| 3. | |  | VfR Aalen | 2 | 2-0-0 | 3:1 | 2 | 6 | |
| 4. |  |  | Hallescher FC | 2 | 1-1-0 | 4:1 | 3 | 4 | |
| 5. | |  | SF Lotte | 2 | 1-1-0 | 3:0 | 3 | 4 | |
| 6. | |  | VfL Osnabrück | 2 | 1-1-0 | 2:1 | 1 | 4 | |
| 7. | |  | MSV Duisburg | 2 | 1-1-0 | 2:1 | 1 | 4 | |
| 8. | |  | SC Paderborn | 2 | 1-0-1 | 3:2 | 1 | 3 | |
| 9. | |  | FC Hansa Rostock | 2 | 1-0-1 | 1:2 | -1 | 3 | |
| 10. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 2 | 1-0-1 | 1:3 | -2 | 3 | |
| 11. | |  | Chemnitzer FC | 2 | 0-2-0 | 1:1 | 0 | 2 | |
| 12. | |  | FSV Zwickau | 1 | 0-1-0 | 2:2 | 0 | 1 | |
| 13. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 2 | 0-1-1 | 3:4 | -1 | 1 | |
| 14. | |  | Holstein Kiel | 2 | 0-1-1 | 1:2 | -1 | 1 | |
| 15. | |  | FSV Frankfurt | 2 | 0-1-1 | 1:2 | -1 | 1 | |
| 16. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 2 | 0-1-1 | 1:2 | -1 | 1 | |
| 17. | |  | FSV Mainz 05 II | 2 | 0-1-1 | 3:5 | -2 | 1 | |
| 18. | |  | SC Preußen Münster | 2 | 0-0-2 | 0:2 | -2 | 0 | |
| 19. | |  | 1. FC Magdeburg | 1 | 0-0-1 | 0:3 | -3 | 0 | |
| 20. | |  | SV Werder Bremen II | 2 | 0-0-2 | 0:5 | -5 | 0 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||