| Fr., 03.03.2017 | Chemnitzer FC - SC Fortuna Köln | 3:1 |
| Sa., 04.03.2017 | Holstein Kiel - SC Paderborn | 2:1 |
| Sa., 04.03.2017 | FC Rot-Weiß Erfurt - FSV Zwickau | 1:3 |
| Sa., 04.03.2017 | SSV Jahn Regensburg - SF Lotte | 2:0 |
| Sa., 04.03.2017 | FC Hansa Rostock - VfR Aalen | 1:1 |
| Sa., 04.03.2017 | SG Sonnenhof Großaspach - FSV Frankfurt | 3:1 |
| Sa., 04.03.2017 | SC Preußen Münster - Hallescher FC | 1:1 |
| Sa., 04.03.2017 | 1. FC Magdeburg - FSV Mainz 05 II | 1:2 |
| Sa., 04.03.2017 | SV Wehen Wiesbaden - VfL Osnabrück | 2:1 |
| So., 05.03.2017 | SV Werder Bremen II - MSV Duisburg | 0:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 24 | 12-10-2 | 29:15 | 14 | 46 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 25 | 11-6-8 | 37:26 | 11 | 39 | |
| 3. | |  | SSV Jahn Regensburg | 25 | 11-6-8 | 39:33 | 6 | 39 | |
| 4. |  |  | SF Lotte | 24 | 11-4-9 | 37:27 | 10 | 37 | |
| 5. | |  | Chemnitzer FC | 25 | 10-7-8 | 39:31 | 8 | 37 | |
| 6. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 25 | 10-7-8 | 37:31 | 6 | 37 | |
| 7. | |  | Holstein Kiel | 24 | 9-9-6 | 35:20 | 15 | 36 | |
| 8. |  |  | Hallescher FC | 25 | 8-12-5 | 24:19 | 5 | 36 | |
| 9. | |  | VfL Osnabrück | 25 | 10-6-9 | 33:32 | 1 | 36 | |
| 10. | |  | VfR Aalen | 25 | 7-14-4 | 29:24 | 5 | 35 | |
| 11. | |  | FC Hansa Rostock | 25 | 7-12-6 | 28:26 | 2 | 33 | |
| 12. | |  | SC Fortuna Köln | 25 | 9-6-10 | 24:38 | -14 | 33 | |
| 13. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 25 | 8-7-10 | 28:30 | -2 | 31 | |
| 14. | |  | SV Werder Bremen II | 24 | 9-4-11 | 23:35 | -12 | 31 | |
| 15. | |  | FSV Zwickau | 25 | 8-6-11 | 28:35 | -7 | 30 | |
| 16. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 25 | 8-5-12 | 20:33 | -13 | 29 | |
| 17. | |  | FSV Frankfurt | 25 | 6-10-9 | 29:26 | 3 | 28 | |
| 18. | |  | SC Preußen Münster | 25 | 8-4-13 | 31:34 | -3 | 28 | |
| 19. | |  | SC Paderborn | 25 | 8-4-13 | 25:42 | -17 | 28 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 25 | 6-5-14 | 21:39 | -18 | 23 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||