| Fr., 17.03.2017 | SV Werder Bremen II - SC Preußen Münster | 0:1 |
| Sa., 18.03.2017 | VfL Osnabrück - Chemnitzer FC | 3:0 |
| Sa., 18.03.2017 | MSV Duisburg - FC Rot-Weiß Erfurt | 3:2 |
| Sa., 18.03.2017 | FSV Mainz 05 II - Holstein Kiel | 0:3 |
| Sa., 18.03.2017 | VfR Aalen - FSV Frankfurt | 2:0 |
| Sa., 18.03.2017 | SC Fortuna Köln - SG Sonnenhof Großaspach | 2:0 |
| Sa., 18.03.2017 | SC Paderborn - SSV Jahn Regensburg | 0:2 |
| So., 19.03.2017 | 1. FC Magdeburg - SV Wehen Wiesbaden | 0:0 |
| So., 19.03.2017 | SF Lotte - Hallescher FC | 0:0 |
| Mo., 20.03.2017 | FSV Zwickau - FC Hansa Rostock | 2:2 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 28 | 13-11-4 | 32:20 | 12 | 50 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 28 | 13-7-8 | 39:26 | 13 | 46 | |
| 3. | |  | VfR Aalen | 28 | 10-14-4 | 37:25 | 12 | 44 | |
| 4. |  |  | SSV Jahn Regensburg | 28 | 12-7-9 | 44:37 | 7 | 43 | |
| 5. | |  | Holstein Kiel | 27 | 11-9-7 | 41:22 | 19 | 42 | |
| 6. | |  | VfL Osnabrück | 28 | 12-6-10 | 38:34 | 4 | 42 | |
| 7. |  |  | SF Lotte | 27 | 12-5-10 | 39:29 | 10 | 41 | |
| 8. | |  | Chemnitzer FC | 28 | 11-7-10 | 41:36 | 5 | 40 | |
| 9. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 28 | 11-7-10 | 39:35 | 4 | 40 | |
| 10. | |  | Hallescher FC | 28 | 9-13-6 | 26:23 | 3 | 40 | |
| 11. | |  | SC Fortuna Köln | 28 | 10-8-10 | 29:41 | -12 | 38 | |
| 12. | |  | FSV Zwickau | 28 | 10-7-11 | 33:38 | -5 | 37 | |
| 13. | |  | FC Hansa Rostock | 28 | 7-14-7 | 31:31 | 0 | 35 | |
| 14. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 28 | 9-8-11 | 29:32 | -3 | 35 | |
| 15. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 28 | 10-5-13 | 24:36 | -12 | 35 | |
| 16. | |  | SV Werder Bremen II | 28 | 10-5-13 | 24:37 | -13 | 35 | |
| 17. | |  | SC Preußen Münster | 28 | 10-4-14 | 34:36 | -2 | 34 | |
| 18. | |  | FSV Frankfurt | 28 | 6-10-12 | 30:31 | -1 | 28 | |
| 19. | |  | SC Paderborn | 28 | 8-4-16 | 26:47 | -21 | 28 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 28 | 7-5-16 | 23:43 | -20 | 26 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||