| Fr., 26.08.2016 | 1. FC Magdeburg - MSV Duisburg | 1:2 |
| Fr., 26.08.2016 | SV Werder Bremen II - VfL Osnabrück | 4:2 |
| Sa., 27.08.2016 | Chemnitzer FC - SF Lotte | 0:1 |
| Sa., 27.08.2016 | SC Preußen Münster - FSV Mainz 05 II | 1:0 |
| Sa., 27.08.2016 | FC Rot-Weiß Erfurt - SC Fortuna Köln | 3:0 |
| Sa., 27.08.2016 | Holstein Kiel - FSV Zwickau | 3:0 |
| Sa., 27.08.2016 | SV Wehen Wiesbaden - SC Paderborn | 1:2 |
| Sa., 27.08.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - Hallescher FC | 3:0 |
| Sa., 27.08.2016 | FC Hansa Rostock - FSV Frankfurt | 1:1 |
| Sa., 27.08.2016 | SSV Jahn Regensburg - VfR Aalen | 0:2 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 5 | 3-2-0 | 9:3 | 6 | 11 | |
| 2. | |  | VfR Aalen | 5 | 3-2-0 | 7:3 | 4 | 11 | |
| 3. |  |  | SSV Jahn Regensburg | 5 | 3-1-1 | 9:6 | 3 | 10 | |
| 4. | |  | SC Fortuna Köln | 5 | 3-0-2 | 6:6 | 0 | 9 | |
| 5. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 5 | 2-2-1 | 8:4 | 4 | 8 | |
| 6. | |  | SF Lotte | 5 | 2-2-1 | 7:5 | 2 | 8 | |
| 7. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 5 | 2-2-1 | 6:5 | 1 | 8 | |
| 8. | |  | VfL Osnabrück | 5 | 2-2-1 | 9:9 | 0 | 8 | |
| 9. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 5 | 2-1-2 | 8:4 | 4 | 7 | |
| 10. | |  | Holstein Kiel | 5 | 2-1-2 | 7:4 | 3 | 7 | |
| 11. | |  | Chemnitzer FC | 5 | 1-3-1 | 5:5 | 0 | 6 | |
| 12. | |  | FC Hansa Rostock | 5 | 1-3-1 | 2:3 | -1 | 6 | |
| 13. | |  | SC Paderborn | 5 | 2-0-3 | 6:8 | -2 | 6 | |
| 14. | |  | SV Werder Bremen II | 5 | 2-0-3 | 7:11 | -4 | 6 | |
| 15. | |  | Hallescher FC | 5 | 1-2-2 | 4:6 | -2 | 5 | |
| 16. | |  | FSV Zwickau | 5 | 1-2-2 | 5:9 | -4 | 5 | |
| 17. | |  | 1. FC Magdeburg | 5 | 1-1-3 | 6:8 | -2 | 4 | |
| 18. | |  | SC Preußen Münster | 5 | 1-1-3 | 2:5 | -3 | 4 | |
| 19. | |  | FSV Frankfurt | 5 | 0-3-2 | 4:6 | -2 | 3 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 5 | 0-2-3 | 5:12 | -7 | 2 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||