| Fr., 16.12.2016 | SG Sonnenhof Großaspach - FC Rot-Weiß Erfurt | 2:1 |
| Sa., 17.12.2016 | FC Hansa Rostock - Chemnitzer FC | 1:3 |
| Sa., 17.12.2016 | SC Paderborn - VfL Osnabrück | 3:1 |
| Sa., 17.12.2016 | SC Fortuna Köln - FSV Mainz 05 II | 1:0 |
| Sa., 17.12.2016 | SF Lotte - 1. FC Magdeburg | 1:3 |
| Sa., 17.12.2016 | VfR Aalen - SV Werder Bremen II | 3:0 |
| Sa., 17.12.2016 | FSV Frankfurt - SV Wehen Wiesbaden | 3:1 |
| Sa., 17.12.2016 | Hallescher FC - Holstein Kiel | 0:0 |
| Sa., 17.12.2016 | SSV Jahn Regensburg - SC Preußen Münster | 3:1 |
| So., 18.12.2016 | FSV Zwickau - MSV Duisburg | 1:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 19 | 9-8-2 | 21:11 | 10 | 35 | |
| 2. |  |  | 1. FC Magdeburg | 19 | 10-3-6 | 30:20 | 10 | 33 | |
| 3. |  |  | VfL Osnabrück | 19 | 9-5-5 | 26:22 | 4 | 32 | |
| 4. | |  | Hallescher FC | 19 | 7-9-3 | 20:14 | 6 | 30 | |
| 5. | |  | Chemnitzer FC | 19 | 8-5-6 | 30:23 | 7 | 29 | |
| 6. | |  | Holstein Kiel | 19 | 7-7-5 | 26:15 | 11 | 28 | |
| 7. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 19 | 8-4-7 | 29:23 | 6 | 28 | |
| 8. | |  | VfR Aalen | 19 | 6-10-3 | 22:17 | 5 | 28 | |
| 9. | |  | SF Lotte | 19 | 8-4-7 | 27:23 | 4 | 28 | |
| 10. | |  | SC Fortuna Köln | 19 | 8-4-7 | 19:27 | -8 | 28 | |
| 11. | |  | SSV Jahn Regensburg | 19 | 8-3-8 | 31:29 | 2 | 27 | |
| 12. | |  | FSV Frankfurt | 19 | 6-8-5 | 27:17 | 10 | 26 | |
| 13. | |  | FC Hansa Rostock | 19 | 6-8-5 | 24:21 | 3 | 26 | |
| 14. | |  | SC Paderborn | 19 | 7-3-9 | 22:36 | -14 | 24 | |
| 15. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 19 | 6-4-9 | 16:25 | -9 | 22 | |
| 16. | |  | SC Preußen Münster | 19 | 6-3-10 | 21:23 | -2 | 21 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 19 | 6-3-10 | 17:31 | -14 | 21 | |
| 18. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 19 | 5-5-9 | 21:25 | -4 | 20 | |
| 19. | |  | FSV Zwickau | 19 | 4-5-10 | 20:29 | -9 | 17 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 19 | 3-5-11 | 14:32 | -18 | 14 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||