| Fr., 31.03.2017 | FSV Mainz 05 II - Chemnitzer FC | 0:1 |
| Sa., 01.04.2017 | 1. FC Magdeburg - FC Rot-Weiß Erfurt | 2:0 |
| Sa., 01.04.2017 | SV Werder Bremen II - Holstein Kiel | 0:2 |
| Sa., 01.04.2017 | SF Lotte - VfR Aalen | 0:2 |
| Sa., 01.04.2017 | SC Fortuna Köln - FSV Frankfurt | 0:0 |
| Sa., 01.04.2017 | SC Paderborn - SG Sonnenhof Großaspach | 1:2 |
| Sa., 01.04.2017 | MSV Duisburg - SSV Jahn Regensburg | 1:1 |
| So., 02.04.2017 | SV Wehen Wiesbaden - SC Preußen Münster | 1:0 |
| So., 02.04.2017 | FSV Zwickau - Hallescher FC | 2:0 |
| So., 02.04.2017 | VfL Osnabrück - FC Hansa Rostock | 2:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 30 | 14-12-4 | 36:23 | 13 | 54 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 30 | 14-8-8 | 42:27 | 15 | 50 | |
| 3. | |  | VfL Osnabrück | 30 | 14-6-10 | 42:36 | 6 | 48 | |
| 4. | |  | Holstein Kiel | 30 | 12-11-7 | 44:23 | 21 | 47 | |
| 5. | |  | VfR Aalen | 30 | 11-14-5 | 40:27 | 13 | 47 | |
| 6. | |  | SSV Jahn Regensburg | 30 | 12-8-10 | 46:40 | 6 | 44 | |
| 7. |  |  | Chemnitzer FC | 30 | 12-7-11 | 44:39 | 5 | 43 | |
| 8. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 30 | 12-7-11 | 42:38 | 4 | 43 | |
| 9. | |  | FSV Zwickau | 30 | 12-7-11 | 37:39 | -2 | 43 | |
| 10. |  |  | SF Lotte | 30 | 12-6-12 | 39:33 | 6 | 42 | |
| 11. | |  | Hallescher FC | 30 | 9-14-7 | 26:25 | 1 | 41 | |
| 12. | |  | SC Fortuna Köln | 30 | 10-10-10 | 29:41 | -12 | 40 | |
| 13. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 29 | 10-8-11 | 30:32 | -2 | 38 | |
| 14. | |  | SC Preußen Münster | 30 | 11-4-15 | 36:38 | -2 | 37 | |
| 15. | |  | FC Hansa Rostock | 30 | 7-15-8 | 33:34 | -1 | 36 | |
| 16. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 30 | 10-6-14 | 24:38 | -14 | 36 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 29 | 10-5-14 | 24:39 | -15 | 35 | |
| 18. | |  | FSV Frankfurt | 30 | 7-11-12 | 32:31 | 1 | 32 | |
| 19. | |  | SC Paderborn | 30 | 8-5-17 | 28:50 | -22 | 29 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 30 | 7-6-17 | 23:44 | -21 | 27 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||