| Di., 04.04.2017 | VfR Aalen - SC Fortuna Köln | 3:0 |
| Di., 04.04.2017 | FC Rot-Weiß Erfurt - SV Werder Bremen II | 1:1 |
| Di., 04.04.2017 | SSV Jahn Regensburg - FSV Mainz 05 II | 2:1 |
| Di., 04.04.2017 | Chemnitzer FC - 1. FC Magdeburg | 1:1 |
| Mi., 05.04.2017 | FSV Frankfurt - FSV Zwickau | 0:1 |
| Mi., 05.04.2017 | Hallescher FC - SC Paderborn | 1:1 |
| Mi., 05.04.2017 | SC Preußen Münster - SF Lotte | 1:0 |
| Mi., 05.04.2017 | Holstein Kiel - SV Wehen Wiesbaden | 3:0 |
| Mi., 05.04.2017 | FC Hansa Rostock - MSV Duisburg | 1:0 |
| Mi., 05.04.2017 | SG Sonnenhof Großaspach - VfL Osnabrück | 1:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 31 | 14-12-5 | 36:24 | 12 | 54 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 31 | 14-9-8 | 43:28 | 15 | 51 | |
| 3. |  |  | Holstein Kiel | 31 | 13-11-7 | 47:23 | 24 | 50 | |
| 4. | |  | VfR Aalen | 31 | 12-14-5 | 43:27 | 16 | 50 | |
| 5. |  |  | VfL Osnabrück | 31 | 14-6-11 | 42:37 | 5 | 48 | |
| 6. | |  | SSV Jahn Regensburg | 31 | 13-8-10 | 48:41 | 7 | 47 | |
| 7. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 31 | 13-7-11 | 43:38 | 5 | 46 | |
| 8. | |  | FSV Zwickau | 31 | 13-7-11 | 38:39 | -1 | 46 | |
| 9. | |  | Chemnitzer FC | 31 | 12-8-11 | 45:40 | 5 | 44 | |
| 10. | |  | SF Lotte | 31 | 12-6-13 | 39:34 | 5 | 42 | |
| 11. | |  | Hallescher FC | 31 | 9-15-7 | 27:26 | 1 | 42 | |
| 12. | |  | SC Preußen Münster | 31 | 12-4-15 | 37:38 | -1 | 40 | |
| 13. | |  | SC Fortuna Köln | 31 | 10-10-11 | 29:44 | -15 | 40 | |
| 14. | |  | FC Hansa Rostock | 31 | 8-15-8 | 34:34 | 0 | 39 | |
| 15. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 30 | 10-8-12 | 30:35 | -5 | 38 | |
| 16. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 31 | 10-7-14 | 25:39 | -14 | 37 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 30 | 10-6-14 | 25:40 | -15 | 36 | |
| 18. | |  | FSV Frankfurt | 31 | 7-11-13 | 32:32 | 0 | 32 | |
| 19. | |  | SC Paderborn | 31 | 8-6-17 | 29:51 | -22 | 30 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 31 | 7-6-18 | 24:46 | -22 | 27 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||