| So., 07.09.2008 | Hertha BSC Berlin II - SV Wilhelmshaven | 1:3 |
| Fr., 19.09.2008 | SV Babelsberg 03 - Altonaer FC 93 | 2:0 |
| Sa., 20.09.2008 | Hallescher FC - FC Energie Cottbus II | 2:1 |
| Sa., 20.09.2008 | Holstein Kiel - Türkiyemspor Berlin | 1:0 |
| Sa., 20.09.2008 | Hannover 96 II - FC Oberneuland 1948 | 1:2 |
| Sa., 20.09.2008 | VfL Wolfsburg II - VfB Lübeck | 1:1 |
| So., 21.09.2008 | VFC Plauen - FC Sachsen Leipzig | 1:0 |
| So., 21.09.2008 | FC Hansa Rostock II - Chemnitzer FC | 0:4 |
| So., 21.09.2008 | Hamburger SV II - 1. FC Magdeburg | 0:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | SV Babelsberg 03 | 5 | 4-1-0 | 7:1 | 6 | 13 |
| 2. | |  | Holstein Kiel | 5 | 4-0-1 | 10:4 | 6 | 12 |
| 3. |  |  | Hallescher FC | 5 | 3-2-0 | 6:3 | 3 | 11 |
| 4. | |  | VFC Plauen | 5 | 2-3-0 | 7:4 | 3 | 9 |
| 5. |  |  | Hamburger SV II | 5 | 2-2-1 | 8:4 | 4 | 8 |
| 6. | |  | VfL Wolfsburg II | 5 | 2-2-1 | 7:3 | 4 | 8 |
| 7. | |  | SV Wilhelmshaven | 5 | 2-2-1 | 7:7 | 0 | 8 |
| 8. | |  | FC Oberneuland 1948 | 4 | 2-1-1 | 5:4 | 1 | 7 |
| 9. | |  | 1. FC Magdeburg | 5 | 2-0-3 | 4:5 | -1 | 6 |
| 10. | |  | Hannover 96 II | 5 | 2-0-3 | 5:7 | -2 | 6 |
| 11. | |  | Altonaer FC 93 | 5 | 2-0-3 | 8:13 | -5 | 6 |
| 12. | |  | FC Hansa Rostock II | 5 | 2-0-3 | 4:10 | -6 | 6 |
| 13. | |  | FC Sachsen Leipzig | 5 | 1-2-2 | 3:4 | -1 | 5 |
| 14. | |  | Chemnitzer FC | 4 | 1-1-2 | 9:7 | 2 | 4 |
| 15. | |  | VfB Lübeck | 5 | 1-1-3 | 6:5 | 1 | 4 |
| 16. | |  | Türkiyemspor Berlin | 5 | 1-1-3 | 5:8 | -3 | 4 |
| 17. | |  | Hertha BSC Berlin II | 5 | 1-1-3 | 5:12 | -7 | 4 |
| 18. | |  | FC Energie Cottbus II | 5 | 0-1-4 | 3:8 | -5 | 1 |