| Fr., 31.03.2006 | SG Wattenscheid 09 - VfL Osnabrück | 3:3 |
| Sa., 01.04.2006 | FC St. Pauli - Chemnitzer FC | 3:2 |
| Sa., 01.04.2006 | FC Rot-Weiß Erfurt - Bayer Leverkusen II | 3:1 |
| Sa., 01.04.2006 | BSV Kickers Emden - Wuppertaler SV | 2:0 |
| Sa., 01.04.2006 | VfB Lübeck - Rot-Weiß Oberhausen | 4:0 |
| Sa., 01.04.2006 | Rot-Weiß Essen - Holstein Kiel | 2:1 |
| Sa., 01.04.2006 | 1. FC Köln II - FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |
| So., 02.04.2006 | Hamburger SV II - SC Preußen Münster | 0:2 |
| So., 02.04.2006 | SV Werder Bremen II - Hertha BSC Berlin II | 2:1 |
| spielfrei | Fortuna Düsseldorf |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Rot-Weiß Essen | 29 | 19-5-5 | 55:28 | 27 | 62 | |
| 2. | |  | FC Carl Zeiss Jena | 27 | 17-4-6 | 50:28 | 22 | 55 | |
| 3. |  |  | VfB Lübeck | 27 | 15-8-4 | 44:26 | 18 | 53 | |
| 4. | |  | FC St. Pauli | 28 | 15-7-6 | 44:27 | 17 | 52 | |
| 5. |  |  | Holstein Kiel | 26 | 15-6-5 | 46:29 | 17 | 51 | |
| 6. | |  | Fortuna Düsseldorf | 28 | 12-8-8 | 45:37 | 8 | 44 | |
| 7. | |  | VfL Osnabrück | 27 | 12-5-10 | 48:43 | 5 | 41 | |
| 8. | |  | Hertha BSC Berlin II | 26 | 12-3-11 | 41:35 | 6 | 39 | |
| 9. | |  | Wuppertaler SV | 28 | 10-9-9 | 31:33 | -2 | 39 | |
| 10. | |  | BSV Kickers Emden | 27 | 10-6-11 | 38:35 | 3 | 36 | |
| 11. | |  | Bayer Leverkusen II | 28 | 9-5-14 | 43:52 | -9 | 32 | |
| 12. | |  | SC Preußen Münster | 27 | 9-4-14 | 26:39 | -13 | 31 | |
| 13. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 27 | 8-6-13 | 31:42 | -11 | 30 | |
| 14. | |  | Hamburger SV II | 26 | 8-5-13 | 29:34 | -5 | 29 | |
| 15. | |  | SV Werder Bremen II | 27 | 8-5-14 | 35:41 | -6 | 29 | |
| 16. | |  | Rot-Weiß Oberhausen | 28 | 7-8-13 | 23:39 | -16 | 29 | |
| 17. | |  | SG Wattenscheid 09 | 27 | 7-7-13 | 36:48 | -12 | 28 | |
| 18. | |  | 1. FC Köln II | 28 | 6-5-17 | 31:53 | -22 | 23 | |
| 19. | |  | Chemnitzer FC | 25 | 4-4-17 | 24:51 | -27 | 16 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: 1) Die Partie zwischen Fortuna Düsseldorf und dem BSV Kickers Emden (1:2 am 9. Spieltag) wurde vom DFB am 18.11.05 mit 2:0 für Fortuna gewertet, da Kickers-Spieler Falk Schindler positiv getestet wurde. Der Einspruch von Emden brachte am 03.02.06 nur eine Bestätigung des DFB-Urteils.. | |||||||||