| Do., 13.04.2006 | Rot-Weiß Essen - SG Wattenscheid 09 | 0:1 |
| Sa., 15.04.2006 | SV Werder Bremen II - Chemnitzer FC | 1:1 |
| Sa., 15.04.2006 | VfB Lübeck - Bayer Leverkusen II | 3:0 |
| Sa., 15.04.2006 | Fortuna Düsseldorf - Wuppertaler SV | 1:1 |
| Sa., 15.04.2006 | 1. FC Köln II - VfL Osnabrück | 0:0 |
| Sa., 15.04.2006 | FC St. Pauli - Holstein Kiel | 2:2 |
| Sa., 15.04.2006 | FC Rot-Weiß Erfurt - SC Preußen Münster | 1:1 |
| Sa., 15.04.2006 | BSV Kickers Emden - Hertha BSC Berlin II | 1:1 |
| So., 16.04.2006 | Hamburger SV II - FC Carl Zeiss Jena | 0:1 |
| spielfrei | Rot-Weiß Oberhausen |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Rot-Weiß Essen | 31 | 20-5-6 | 59:30 | 29 | 65 | |
| 2. | |  | FC Carl Zeiss Jena | 29 | 19-4-6 | 52:28 | 24 | 61 | |
| 3. | |  | Holstein Kiel | 30 | 17-8-5 | 57:33 | 24 | 59 | |
| 4. | |  | VfB Lübeck | 29 | 16-8-5 | 48:28 | 20 | 56 | |
| 5. | |  | FC St. Pauli | 30 | 15-8-7 | 46:30 | 16 | 53 | |
| 6. | |  | Fortuna Düsseldorf | 30 | 13-9-8 | 48:38 | 10 | 48 | |
| 7. | |  | Hertha BSC Berlin II | 30 | 14-5-11 | 47:38 | 9 | 47 | |
| 8. | |  | Wuppertaler SV | 30 | 11-10-9 | 34:35 | -1 | 43 | |
| 9. | |  | VfL Osnabrück | 29 | 12-6-11 | 49:47 | 2 | 42 | |
| 10. | |  | BSV Kickers Emden | 29 | 10-7-12 | 39:37 | 2 | 37 | |
| 11. | |  | Bayer Leverkusen II | 31 | 10-5-16 | 44:57 | -13 | 35 | |
| 12. | |  | SV Werder Bremen II | 29 | 9-6-14 | 37:42 | -5 | 33 | |
| 13. | |  | SC Preußen Münster | 30 | 9-6-15 | 28:42 | -14 | 33 | |
| 14. |  |  | Hamburger SV II | 29 | 9-5-15 | 31:38 | -7 | 32 | |
| 15. | |  | SG Wattenscheid 09 | 29 | 8-8-13 | 38:49 | -11 | 32 | |
| 16. |  |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 29 | 8-7-14 | 32:44 | -12 | 31 | |
| 17. | |  | Rot-Weiß Oberhausen | 30 | 7-9-14 | 24:42 | -18 | 30 | |
| 18. | |  | 1. FC Köln II | 31 | 6-6-19 | 33:61 | -28 | 24 | |
| 19. | |  | Chemnitzer FC | 29 | 5-6-18 | 29:56 | -27 | 21 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: 1) Die Partie zwischen Fortuna Düsseldorf und dem BSV Kickers Emden (1:2 am 9. Spieltag) wurde vom DFB am 18.11.05 mit 2:0 für Fortuna gewertet, da Kickers-Spieler Falk Schindler positiv getestet wurde. Der Einspruch von Emden brachte am 03.02.06 nur eine Bestätigung des DFB-Urteils.. | |||||||||