| Fr., 23.11.2012 | SpVgg Unterhaching - Chemnitzer FC | 4:3 |
| Sa., 24.11.2012 | SV Babelsberg 03 - SC Preußen Münster | 1:0 |
| Sa., 24.11.2012 | Stuttgarter Kickers - SV Darmstadt 98 | 1:1 |
| Sa., 24.11.2012 | FC Rot-Weiß Erfurt - FC Hansa Rostock | 1:1 |
| Sa., 24.11.2012 | Karlsruher SC - SV Wehen Wiesbaden | 4:0 |
| Sa., 24.11.2012 | Kickers Offenbach - 1. FC Heidenheim 1846 | 0:1 |
| Sa., 24.11.2012 | 1. FC Saarbrücken - Hallescher FC | 5:0 |
| Sa., 24.11.2012 | Borussia Dortmund II - VfB Stuttgart II | 0:2 |
| Sa., 24.11.2012 | Alemannia Aachen - VfL Osnabrück | 0:1 |
| Sa., 24.11.2012 | Arminia Bielefeld - SV Wacker Burghausen | 3:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | VfL Osnabrück | 19 | 12-4-3 | 27:12 | 15 | 40 | |
| 2. | |  | SC Preußen Münster | 19 | 10-6-3 | 31:15 | 16 | 36 | |
| 3. | |  | Arminia Bielefeld | 19 | 10-6-3 | 28:17 | 11 | 36 | |
| 4. | |  | SpVgg Unterhaching | 19 | 10-5-4 | 33:24 | 9 | 35 | |
| 5. | |  | Karlsruher SC | 19 | 9-7-3 | 29:11 | 18 | 34 | |
| 6. |  |  | 1. FC Heidenheim 1846 | 19 | 9-4-6 | 32:26 | 6 | 31 | |
| 7. |  |  | SV Wacker Burghausen | 19 | 9-2-8 | 26:26 | 0 | 29 | |
| 8. | |  | FC Hansa Rostock | 19 | 8-5-6 | 22:24 | -2 | 29 | |
| 9. | |  | VfB Stuttgart II | 19 | 8-4-7 | 26:22 | 4 | 28 | |
| 10. | |  | Kickers Offenbach | 19 | 7-5-7 | 29:23 | 6 | 26 | |
| 11. | |  | Chemnitzer FC | 19 | 7-4-8 | 27:25 | 2 | 25 | |
| 12. | |  | 1. FC Saarbrücken | 19 | 7-3-9 | 28:32 | -4 | 24 | |
| 13. | |  | SV Babelsberg 03 | 19 | 6-4-9 | 16:25 | -9 | 22 | |
| 14. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 19 | 3-12-4 | 24:27 | -3 | 21 | |
| 15. | |  | Hallescher FC | 19 | 4-6-9 | 16:28 | -12 | 18 | |
| 16. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 19 | 4-6-9 | 21:34 | -13 | 18 | |
| 17. | |  | Stuttgarter Kickers | 19 | 4-5-10 | 19:23 | -4 | 17 | |
| 18. | |  | Borussia Dortmund II | 19 | 4-5-10 | 16:33 | -17 | 17 | |
| 19. | |  | Alemannia Aachen | 19 | 3-7-9 | 18:29 | -11 | 16 | |
| 20. | |  | SV Darmstadt 98 | 19 | 3-6-10 | 16:28 | -12 | 15 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Je zwei Punkte Abzug für Alemannia Aachen und Offenbacher Kickers aufgrund Lizenzverstößen ab 29. Spieltag bereits eingerechnet. Ein weiterer Abzug von 3 Punkten für Alemannia Aachen nach dem 37. Spieltag ist ebenfalls eingerechnet. Die Offenbacher Kickers erhielten keine Lizenz für die folgende Spielzeit 2013/2014 und müssen deshalb absteigen. Dafür verbleibt der sportliche Absteiger SV Darmstadt 98 in der Liga. | |||||||||