| Sa., 28.02.2004 | 1. FC Dynamo Dresden - FC St. Pauli | 1:0 |
| Sa., 28.02.2004 | Holstein Kiel - KFC Uerdingen | 0:3 |
| So., 29.02.2004 | Chemnitzer FC - SV Werder Bremen II | 2:1 |
| Mo., 01.03.2004 | Hamburger SV II - Eintracht Braunschweig | 1:0 |
| Di., 30.03.2004 | SC Paderborn - 1. FC Köln II | 2:0 |
| Di., 30.03.2004 | FC Schalke 04 II - FC Sachsen Leipzig | 1:1 |
| Di., 30.03.2004 | Wuppertaler SV - SG Wattenscheid 09 | 0:1 |
| Di., 30.03.2004 | Rot-Weiß Essen - VfR Neumünster | 5:1 |
| Di., 30.03.2004 | Borussia Dortmund II - SC Preußen Münster | 1:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Wuppertaler SV | 19 | 12-4-3 | 30:17 | 13 | 40 |
| 2. |  |  | 1. FC Dynamo Dresden | 20 | 11-6-3 | 28:15 | 13 | 39 |
| 3. |  |  | SV Werder Bremen II | 20 | 11-4-5 | 34:21 | 13 | 37 |
| 4. | |  | Borussia Dortmund II | 19 | 10-5-4 | 32:19 | 13 | 35 |
| 5. | |  | Rot-Weiß Essen | 19 | 10-3-6 | 36:19 | 17 | 33 |
| 6. | |  | SC Paderborn | 19 | 9-6-4 | 26:21 | 5 | 33 |
| 7. | |  | KFC Uerdingen | 20 | 8-4-8 | 31:27 | 4 | 28 |
| 8. | |  | FC St. Pauli | 20 | 7-6-7 | 30:23 | 7 | 27 |
| 9. | |  | Eintracht Braunschweig | 20 | 8-3-9 | 26:26 | 0 | 27 |
| 10. | |  | Chemnitzer FC | 20 | 8-3-9 | 19:26 | -7 | 27 |
| 11. | |  | Holstein Kiel | 20 | 6-6-8 | 32:38 | -6 | 24 |
| 12. | |  | 1. FC Köln II | 19 | 5-7-7 | 28:33 | -5 | 22 |
| 13. | |  | Hamburger SV II | 20 | 5-7-8 | 18:31 | -13 | 22 |
| 14. | |  | FC Schalke 04 II | 19 | 6-2-11 | 28:39 | -11 | 20 |
| 15. | |  | FC Sachsen Leipzig | 19 | 4-7-8 | 25:30 | -5 | 19 |
| 16. | |  | SG Wattenscheid 09 | 19 | 5-4-10 | 27:39 | -12 | 19 |
| 17. | |  | SC Preußen Münster | 19 | 4-6-9 | 19:27 | -8 | 18 |
| 18. | |  | VfR Neumünster | 19 | 0-9-10 | 17:35 | -18 | 9 |