| Fr., 26.09.2003 | Wuppertaler SV - Rot-Weiß Essen | 2:0 |
| Fr., 26.09.2003 | Eintracht Braunschweig - Borussia Dortmund II | 0:1 |
| Sa., 27.09.2003 | 1. FC Dynamo Dresden - Chemnitzer FC | 2:0 |
| Sa., 27.09.2003 | SC Preußen Münster - SV Werder Bremen II | 0:2 |
| Sa., 27.09.2003 | FC St. Pauli - SC Paderborn | 2:0 |
| Sa., 27.09.2003 | Hamburger SV II - Holstein Kiel | 1:1 |
| Sa., 27.09.2003 | KFC Uerdingen - FC Sachsen Leipzig | 2:1 |
| Sa., 27.09.2003 | SG Wattenscheid 09 - FC Schalke 04 II | 1:4 |
| So., 28.09.2003 | VfR Neumünster - 1. FC Köln II | 2:2 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Wuppertaler SV | 9 | 6-2-1 | 16:6 | 10 | 20 |
| 2. | |  | Borussia Dortmund II | 9 | 6-2-1 | 16:9 | 7 | 20 |
| 3. |  |  | Eintracht Braunschweig | 9 | 6-1-2 | 16:9 | 7 | 19 |
| 4. |  |  | SC Paderborn | 9 | 5-2-2 | 12:10 | 2 | 17 |
| 5. | |  | FC Schalke 04 II | 9 | 5-1-3 | 20:15 | 5 | 16 |
| 6. | |  | 1. FC Dynamo Dresden | 9 | 4-3-2 | 17:10 | 7 | 15 |
| 7. | |  | FC St. Pauli | 9 | 4-3-2 | 17:10 | 7 | 15 |
| 8. | |  | SV Werder Bremen II | 9 | 4-3-2 | 12:9 | 3 | 15 |
| 9. | |  | KFC Uerdingen | 9 | 4-2-3 | 15:12 | 3 | 14 |
| 10. | |  | Rot-Weiß Essen | 9 | 4-2-3 | 14:11 | 3 | 14 |
| 11. | |  | Chemnitzer FC | 9 | 4-2-3 | 10:9 | 1 | 14 |
| 12. | |  | 1. FC Köln II | 9 | 2-5-2 | 15:13 | 2 | 11 |
| 13. | |  | SG Wattenscheid 09 | 9 | 2-1-6 | 16:24 | -8 | 7 |
| 14. | |  | Holstein Kiel | 9 | 1-3-5 | 12:20 | -8 | 6 |
| 15. | |  | SC Preußen Münster | 9 | 1-3-5 | 7:16 | -9 | 6 |
| 16. | |  | Hamburger SV II | 9 | 1-3-5 | 8:18 | -10 | 6 |
| 17. | |  | FC Sachsen Leipzig | 9 | 1-2-6 | 12:19 | -7 | 5 |
| 18. | |  | VfR Neumünster | 9 | 0-2-7 | 7:22 | -15 | 2 |