| Sa., 27.05.2006 | Wuppertaler SV - Chemnitzer FC | 3:1 |
| Sa., 27.05.2006 | FC St. Pauli - Hamburger SV II | 1:1 |
| Sa., 27.05.2006 | SV Werder Bremen II - 1. FC Köln II | 2:2 |
| Sa., 27.05.2006 | FC Rot-Weiß Erfurt - Rot-Weiß Essen | 0:1 |
| Sa., 27.05.2006 | BSV Kickers Emden - SG Wattenscheid 09 | 1:0 |
| Sa., 27.05.2006 | VfB Lübeck - VfL Osnabrück | 2:0 |
| Sa., 27.05.2006 | Fortuna Düsseldorf - Holstein Kiel | 3:0 |
| Sa., 27.05.2006 | Rot-Weiß Oberhausen - FC Carl Zeiss Jena | 1:0 |
| Sa., 27.05.2006 | Bayer Leverkusen II - SC Preußen Münster | 1:3 |
| spielfrei | Hertha BSC Berlin II |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Rot-Weiß Essen | 36 | 23-7-6 | 67:34 | 33 | 76 | |
| 2. | |  | FC Carl Zeiss Jena | 36 | 22-6-8 | 58:32 | 26 | 72 | |
| 3. |  |  | VfB Lübeck | 36 | 20-9-7 | 60:36 | 24 | 69 | |
| 4. |  |  | Holstein Kiel | 36 | 19-9-8 | 64:42 | 22 | 66 | |
| 5. | |  | Fortuna Düsseldorf | 36 | 18-9-9 | 62:47 | 15 | 63 | |
| 6. | |  | FC St. Pauli | 36 | 17-10-9 | 53:38 | 15 | 61 | |
| 7. | |  | Hertha BSC Berlin II | 36 | 16-7-13 | 54:44 | 10 | 55 | |
| 8. | |  | Wuppertaler SV | 36 | 13-12-11 | 42:42 | 0 | 51 | |
| 9. | |  | BSV Kickers Emden | 36 | 14-7-15 | 50:45 | 5 | 49 | |
| 10. | |  | VfL Osnabrück | 36 | 14-7-15 | 56:58 | -2 | 49 | |
| 11. | |  | Bayer Leverkusen II | 36 | 13-5-18 | 56:64 | -8 | 44 | |
| 12. | |  | SV Werder Bremen II | 36 | 11-10-15 | 46:47 | -1 | 43 | |
| 13. | |  | Hamburger SV II | 36 | 12-7-17 | 45:48 | -3 | 43 | |
| 14. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 36 | 11-9-16 | 40:48 | -8 | 42 | |
| 15. | |  | SC Preußen Münster | 36 | 12-6-18 | 37:49 | -12 | 42 | |
| 16. | |  | SG Wattenscheid 09 | 36 | 10-9-17 | 50:65 | -15 | 39 | |
| 17. | |  | Rot-Weiß Oberhausen | 36 | 10-9-17 | 30:53 | -23 | 39 | |
| 18. | |  | 1. FC Köln II | 36 | 6-8-22 | 39:74 | -35 | 26 | |
| 19. | |  | Chemnitzer FC | 36 | 5-6-25 | 35:78 | -43 | 21 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: 1) Die Partie zwischen Fortuna Düsseldorf und dem BSV Kickers Emden (1:2 am 9. Spieltag) wurde vom DFB am 18.11.05 mit 2:0 für Fortuna gewertet, da Kickers-Spieler Falk Schindler positiv getestet wurde. Der Einspruch von Emden brachte am 03.02.06 nur eine Bestätigung des DFB-Urteils.. | |||||||||