| Sa., 25.03.2017 | Chemnitzer FC - MSV Duisburg | 2:3 |
| Sa., 25.03.2017 | FC Hansa Rostock - SC Paderborn | 1:1 |
| Sa., 25.03.2017 | SG Sonnenhof Großaspach - FSV Zwickau | 1:2 |
| Sa., 25.03.2017 | Hallescher FC - SC Fortuna Köln | 0:0 |
| Sa., 25.03.2017 | FSV Frankfurt - SF Lotte | 2:0 |
| Sa., 25.03.2017 | SC Preußen Münster - VfR Aalen | 2:1 |
| Sa., 25.03.2017 | Holstein Kiel - 1. FC Magdeburg | 1:1 |
| Sa., 25.03.2017 | FC Rot-Weiß Erfurt - FSV Mainz 05 II | 0:0 |
| Sa., 25.03.2017 | SSV Jahn Regensburg - VfL Osnabrück | 1:2 |
| Mi., 19.04.2017 | SV Wehen Wiesbaden - SV Werder Bremen II | 2:0 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | MSV Duisburg | 29 | 14-11-4 | 35:22 | 13 | 53 | |
| 2. | |  | 1. FC Magdeburg | 29 | 13-8-8 | 40:27 | 13 | 47 | |
| 3. |  |  | VfL Osnabrück | 29 | 13-6-10 | 40:35 | 5 | 45 | |
| 4. | |  | Holstein Kiel | 29 | 11-11-7 | 42:23 | 19 | 44 | |
| 5. |  |  | VfR Aalen | 29 | 10-14-5 | 38:27 | 11 | 44 | |
| 6. | |  | SSV Jahn Regensburg | 29 | 12-7-10 | 45:39 | 6 | 43 | |
| 7. | |  | SF Lotte | 29 | 12-6-11 | 39:31 | 8 | 42 | |
| 8. | |  | Hallescher FC | 29 | 9-14-6 | 26:23 | 3 | 41 | |
| 9. | |  | Chemnitzer FC | 29 | 11-7-11 | 43:39 | 4 | 40 | |
| 10. | |  | SG Sonnenhof Großaspach | 29 | 11-7-11 | 40:37 | 3 | 40 | |
| 11. | |  | FSV Zwickau | 29 | 11-7-11 | 35:39 | -4 | 40 | |
| 12. | |  | SC Fortuna Köln | 29 | 10-9-10 | 29:41 | -12 | 39 | |
| 13. | |  | SC Preußen Münster | 29 | 11-4-14 | 36:37 | -1 | 37 | |
| 14. | |  | FC Hansa Rostock | 29 | 7-15-7 | 32:32 | 0 | 36 | |
| 15. | |  | FC Rot-Weiß Erfurt | 29 | 10-6-13 | 24:36 | -12 | 36 | |
| 16. | |  | SV Wehen Wiesbaden | 28 | 9-8-11 | 29:32 | -3 | 35 | |
| 17. | |  | SV Werder Bremen II | 28 | 10-5-13 | 24:37 | -13 | 35 | |
| 18. | |  | FSV Frankfurt | 29 | 7-10-12 | 32:31 | 1 | 31 | |
| 19. | |  | SC Paderborn | 29 | 8-5-16 | 27:48 | -21 | 29 | |
| 20. | |  | FSV Mainz 05 II | 29 | 7-6-16 | 23:43 | -20 | 27 | |
| Bemerkungen zur Tabelle: Dem VfR Aalen wurden wegen eines Insolvenzantrags 9 Punkte abgezogen, der am 18. Mai vom Ständigen Neutralen Schiedsgericht bestätigt wurde. Dem FSV Frankfurt wurden wegen eines Insolvenzantrags am 16. Mai ebenfalls 9 Punkte abgezogen, nachdem der Klub auf den Gang vors DFB-Bundesgericht verzichtet hatte.. | |||||||||